对于再障的治疗，主要为支持治疗和目标治疗。支持治疗的作用是改善症状，通过输血、用抗真菌药物等方法，来缓解或预防贫血、感染等全血细胞减少带来的并发症，适用于所有再障患者。而目标治疗是从根本上解决病因，恢复骨髓造血功能，主要是造血干细胞移植和免疫抑制治疗。
移植可以带来生还康复的希望，但需要注意如何迈开“难关”，获得康复。
重度再障一般都是急性发展，移植的先决条件是病人本身还存在造血功能，哪怕很弱，但这是正常造血源头再生的关键，也是移植前的基础。针对重度再障的一二线治疗内多包括强效免疫抑制剂，中西结合治疗以及造血干细胞移植，如果病情严重，移植寻找配型在早期治疗阶段就可以进行，但如若受到年龄，配型，家庭条件，自身身体素质不符等等限制，那么可以先观察ATG/ALG或是联合方案（中西结合）的疗效，不行再移植。因为目前确然有不通过移植早期也能达到血象安全稳定的病例，达到这样的效果也给后续的治疗也提供了空间。
再障跟其他血液病移植后考虑的问题大体相同，首当其冲就是排异反应，这方面都会服用抗排异药物，一定要慢慢的减量，不可骤然减停，以免影响到总体的病情走向。移植后需要查抗排异药物浓度，保证在有效治疗浓度，半年后如果没有排异再开始慢慢的减药，一般一年左右大多病例没有排异就可以正常停药了。但是如果在移植后反复甚至是加重出现排异反应，那么需要查血药浓度够不够，然后及时加其他的药物。
最后，关于微移植的疑问，目前还不成熟，大多地方医学工作者还在研究当中，并且目前主要是针对成人患者，儿童患者并不普及。在移植方面的选择，第一还是选择“异基因”“全相合”“亲缘供体”造血干细胞移植，成功率会大些。
对于 “一旦确诊再障，就必须移植吗” 的疑问，下文进行相关解析。
目前对于再障是否移植的言论，通常是对于难治性的重型再障病人建议，适应症包括：
重症程度
包括刚开始就确诊为急重型再障以及早期慢性再障后期转为重型再障的病人。
年龄情况
一般来说年龄太大都是不适合移植的，一方面风险的问题，一方面是后期高复发率问题。年纪大的病例也可以评估后决定是否移植，拓展下移植的年龄。对于不适合移植的病人可以中西联合治疗为主，包括免疫抑制剂联合治疗。
供髓配型
如果选择移植，需要了解清楚移植后可能带来的近期并发症以及远期并发症问题，包括排异反应以及相关复发概率，如果平稳度过2年以上的敏感期，后面相对情况就比较乐观了。
总而言之，造血干细胞移植是再生障碍性贫血治疗的有效手段，但不是唯一的治疗办法。无论是选择哪一种治疗，作为患者都需要坚信其治疗带来的效果，树立起康复的信心。
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